Tato práce se zaměřovala na studium šesti kultur bakterií izolovaných ze vzorků stojatých a tekoucích vod. Cílem bylo testovat schopnost těchto kultur růst a degradovat uhlovodíkové polutanty při teplotě 8 °C, což je běžná teplota pro podzemní vody. Testy ukázaly, že se jedná o psychrotrofní bakterie, pravděpodobně Acinetobacter lwoffii/junii. Testován byl růst na těchto látkách: toluen, oktan, hexadekan, resorcinol, N-methyl 2-pyrrolidon, tetradekan, dodekan a dekan. Studované kultury na většině substrátů při 8 °C nerostly, pouze hexadekan a tetradekan se ukázaly být za těchto podmínek pro některé z nich využitelnými uhlíkatými zdroji.
Annotation in English
This work was focused on the study of six bacterial strains isolated from samples of stagnant or flowing water. The goal was to test the ability of these strains to grow and degrade hydrocarbon pollutants at a temperature of 8 °C, which is a common temperature for many groundwater. The results showed that the strains are psychrotrophic bacteria, probably Acinetobacter lwoffii/junii. During the study, the growth of above mentioned bacteria on toluene, octane, hexadecane, resorcinol, N-methyl 2-pyrrolidone, tetradecane, dodecane and decane was tested. The strains were incapable to grow on most of the substrates at 8 °C, but under such condition, hexadecane and tetradecane revealed to be utilizable carbon sources for some of them.
Keywords
Acinetobacter, organické polutanty, psychrotrofní, růst
Tato práce se zaměřovala na studium šesti kultur bakterií izolovaných ze vzorků stojatých a tekoucích vod. Cílem bylo testovat schopnost těchto kultur růst a degradovat uhlovodíkové polutanty při teplotě 8 °C, což je běžná teplota pro podzemní vody. Testy ukázaly, že se jedná o psychrotrofní bakterie, pravděpodobně Acinetobacter lwoffii/junii. Testován byl růst na těchto látkách: toluen, oktan, hexadekan, resorcinol, N-methyl 2-pyrrolidon, tetradekan, dodekan a dekan. Studované kultury na většině substrátů při 8 °C nerostly, pouze hexadekan a tetradekan se ukázaly být za těchto podmínek pro některé z nich využitelnými uhlíkatými zdroji.
Annotation in English
This work was focused on the study of six bacterial strains isolated from samples of stagnant or flowing water. The goal was to test the ability of these strains to grow and degrade hydrocarbon pollutants at a temperature of 8 °C, which is a common temperature for many groundwater. The results showed that the strains are psychrotrophic bacteria, probably Acinetobacter lwoffii/junii. During the study, the growth of above mentioned bacteria on toluene, octane, hexadecane, resorcinol, N-methyl 2-pyrrolidone, tetradecane, dodecane and decane was tested. The strains were incapable to grow on most of the substrates at 8 °C, but under such condition, hexadecane and tetradecane revealed to be utilizable carbon sources for some of them.
Keywords
Acinetobacter, organické polutanty, psychrotrofní, růst
- Vypracujte rešerši zaměřenou na bakteriální degradaci vybraných polutantů za snížených teplot
- Ověřte růst psychrofilních bakterií, využívajících fenol, na dalších uhlovodících a polutantech (např. na toluenu, oktanu, cyklohexanu, na derivátech fenolu, pyrrolidonu apod.)
- Získané poznatky přehledně zpracujte a práci odevzdejte v tištěné i elektronické formě v řádném termínu
Research Plan
- Vypracujte rešerši zaměřenou na bakteriální degradaci vybraných polutantů za snížených teplot
- Ověřte růst psychrofilních bakterií, využívajících fenol, na dalších uhlovodících a polutantech (např. na toluenu, oktanu, cyklohexanu, na derivátech fenolu, pyrrolidonu apod.)
- Získané poznatky přehledně zpracujte a práci odevzdejte v tištěné i elektronické formě v řádném termínu
Recommended resources
R. Margesin a kol.: Low-temperature biodegradation of petroleum hydrocarbons (n-alkanes, phenol, anthracene, pyrene) by four actinobacterial strains. International Biodeterioration & Biodegradation 84, 2013, 185-191.
R. Margesin a kol.: Hydrocarbon degradation and enzyme activities of cold-adapted bacteria and yeasts. Extremophiles 2003, 7:451–458.
Vědecké zdroje zahrnuté v databázích Web of Science, ScienceDirect a Medline.
Recommended resources
R. Margesin a kol.: Low-temperature biodegradation of petroleum hydrocarbons (n-alkanes, phenol, anthracene, pyrene) by four actinobacterial strains. International Biodeterioration & Biodegradation 84, 2013, 185-191.
R. Margesin a kol.: Hydrocarbon degradation and enzyme activities of cold-adapted bacteria and yeasts. Extremophiles 2003, 7:451–458.
Vědecké zdroje zahrnuté v databázích Web of Science, ScienceDirect a Medline.
Enclosed appendices
-
Appendices bound in thesis
illustrations, graphs, tables
Taken from the library
No
Full text of the thesis
Appendices
Reviewer's report
Supervisor's report
Defence procedure record
Otázky oponenta:
1. Vysvětlete na základě Arheniovy rovnice, jak závisí rychlost chemických reakcí obecně na teplotě, co je to aktivační energie chemické reakce a co to znamená pro enzymy, které mají efektivně fungovat v chladu.
2. Při práci s uhlovodíky s vyšším počtem uhlíků jste narazila na problém přechodu těchto látek do pevné fáze. Tento jev je znám a může být důležitý při například při dekontaminaci ropného znečištění za nižších teplot. Navrhněte prosím experiment a analytickou koncovku, který by prokázal schopnost degradace vyšších uhlovodíků v pevném stavu za nižších teplot.
Po prezentaci práce studentkou a po zhodnocení odpovědí studentky na dotazy oponenta byla vedena rozprava, ve které studentka odpovídala na doplňkové dotazy členů komise.
Doplňující otázky:
doc. Bednařík: Jakým způsobem se Vám podařilo změřit hodnotu optické hustoty 6? Má skutečně Vámi použitý přístroj takovou citlivost? Jak je definována optická hustota?
dr. Jančová: Jaké znáte další metody identifikace bakterií?
Na veškeré dotazy odpověděla studentka výborně a bez chyb; po zohlednění návrhů školitele i oponenta pak komise rozhodla o celkovém hodnocení obhajoby.