Práce byla zaměřena na sledování změn zastoupení mikroorganismů během zrání u přírodního sýru typu Eidam. Pro stanovení přítomnosti bakterií se v současnosti, kromě tradičních izolačních technik např. plotnová metoda, používají moderní izolační metody molekulární biologie. Pro výzkum byla použita metoda molekulární biologie TGGE (gelová elektroforéza v teplotním gradientu)
V jednotlivých vzorcích sýra byly nalezeny startérové kultury a non-starterové bakterie mléčného kvašení a také kontaminující bakterie. Na začátku zrání převládaly především startérové kultury, jejichž množství postupně klesalo, naopak v pozdějších stádiích zrání převládaly non-starterové kultury. Ve vzorcích sýra byly identifikovány, především na počátku zrání, i kontaminující bakterie Escherichia coli.
Annotation in English
The work was focused on monitoring changes in the representation of microorganisms dur-ing ripening of Dutch type cheese Edam. In the present, to determine the presence of bacteria is using modern isolation methods of molecular biology. For the research was used method of molecular biology TGGE (Temperature Gradient Gel Electrophoresis).
Starter cultures, non-starter bacteria and contaminating bacteria have been found in indi-vidual samples of cheese. At the beginning of cheese ripening, dominated primarily starter cultures, their number gradually declined, while in the later stages of cheese ripening dominated a non-starter cultures. In individual cheese samples were identified, especially at the beginning of cheese ripening, a contaminating bacteria Escherichia coli.
Keywords
bakterie mléčného kvašení, sýr Eidam, zrání sýrů, gelová elektroforéza v teplotním gradientu, deoxyribonukleová kyselina, polymerázová řetězová reakce
Keywords in English
Lactic Acid Bacteria, Cheese Edam, cheese ripening, Temperature Gradient Gel Electrophoresis, Deoxyribonucleic acid, Polymerase chain reaction
Length of the covering note
82 s.
Language
CZ
Annotation
Práce byla zaměřena na sledování změn zastoupení mikroorganismů během zrání u přírodního sýru typu Eidam. Pro stanovení přítomnosti bakterií se v současnosti, kromě tradičních izolačních technik např. plotnová metoda, používají moderní izolační metody molekulární biologie. Pro výzkum byla použita metoda molekulární biologie TGGE (gelová elektroforéza v teplotním gradientu)
V jednotlivých vzorcích sýra byly nalezeny startérové kultury a non-starterové bakterie mléčného kvašení a také kontaminující bakterie. Na začátku zrání převládaly především startérové kultury, jejichž množství postupně klesalo, naopak v pozdějších stádiích zrání převládaly non-starterové kultury. Ve vzorcích sýra byly identifikovány, především na počátku zrání, i kontaminující bakterie Escherichia coli.
Annotation in English
The work was focused on monitoring changes in the representation of microorganisms dur-ing ripening of Dutch type cheese Edam. In the present, to determine the presence of bacteria is using modern isolation methods of molecular biology. For the research was used method of molecular biology TGGE (Temperature Gradient Gel Electrophoresis).
Starter cultures, non-starter bacteria and contaminating bacteria have been found in indi-vidual samples of cheese. At the beginning of cheese ripening, dominated primarily starter cultures, their number gradually declined, while in the later stages of cheese ripening dominated a non-starter cultures. In individual cheese samples were identified, especially at the beginning of cheese ripening, a contaminating bacteria Escherichia coli.
Keywords
bakterie mléčného kvašení, sýr Eidam, zrání sýrů, gelová elektroforéza v teplotním gradientu, deoxyribonukleová kyselina, polymerázová řetězová reakce
Keywords in English
Lactic Acid Bacteria, Cheese Edam, cheese ripening, Temperature Gradient Gel Electrophoresis, Deoxyribonucleic acid, Polymerase chain reaction
Research Plan
I. Teoretická část
Bakterie mléčného kvašení a jejich úloha při výrobě fermentovaných mléčných výrobků
Využití metod molekulární biologie pro studium bakterií mléčného kvašení
Metoda TGGE a její využití v mikrobiologii
II. Praktická část
Optimalizace metody TGGE pro studium bakterií mléčného kvašení v podmínkách in vitro
Izolace DNA z matrice přírodních sýrů
Sledování dynamiky populace bakterií mléčného kvašení metodou TGGE v přírodních sýrech
Formulace závěrů
Research Plan
I. Teoretická část
Bakterie mléčného kvašení a jejich úloha při výrobě fermentovaných mléčných výrobků
Využití metod molekulární biologie pro studium bakterií mléčného kvašení
Metoda TGGE a její využití v mikrobiologii
II. Praktická část
Optimalizace metody TGGE pro studium bakterií mléčného kvašení v podmínkách in vitro
Izolace DNA z matrice přírodních sýrů
Sledování dynamiky populace bakterií mléčného kvašení metodou TGGE v přírodních sýrech
Formulace závěrů
Recommended resources
ADAMS, R. Martin a Maurice O. MOSS. Food Microbiology. 3rd ed. Cambridge: RSC Publishing, 2008. ISBN 978-0-85404-284-5
WARTELL, M.R.; HOSSEINI, S.; POWELL. S., et al. Detecting single base substitutions, mismatches and bulges in DNA by temperature gradientgel electrophoresis and related methods. Journal of Chromatography A. 1998, vol. 806, s. 169-185
MUYZER, G; SMALLA, K. Application of Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) and Temperature Gradient Gel Electrophoresis (TGGE) in Microbial Ecology. Antonie Van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Mikrobiology. 1998, vol. 73, no. 1 s. 127-141. ISSN:0003-6072
MUYZER, G. DGGE/TGGE a Metod for identifying genes from natural ecosystemes. Current opinion in mikrobiology. 1999, vol. 2, no. 3, s. 317-322
Recommended resources
ADAMS, R. Martin a Maurice O. MOSS. Food Microbiology. 3rd ed. Cambridge: RSC Publishing, 2008. ISBN 978-0-85404-284-5
WARTELL, M.R.; HOSSEINI, S.; POWELL. S., et al. Detecting single base substitutions, mismatches and bulges in DNA by temperature gradientgel electrophoresis and related methods. Journal of Chromatography A. 1998, vol. 806, s. 169-185
MUYZER, G; SMALLA, K. Application of Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) and Temperature Gradient Gel Electrophoresis (TGGE) in Microbial Ecology. Antonie Van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Mikrobiology. 1998, vol. 73, no. 1 s. 127-141. ISSN:0003-6072
MUYZER, G. DGGE/TGGE a Metod for identifying genes from natural ecosystemes. Current opinion in mikrobiology. 1999, vol. 2, no. 3, s. 317-322
