Předložená diplomová práce je zaměřená na fenotypovou identifikaci a charakterizaci producentů PHA. Teoretická část diplomové práce se zabývá charakterizací polyhydroxyalkanoatu s jejich mozností získávání z producentů a jejich využitím. Dále v teoretické části najdeme charakterizaci samotných mikroorganismů produkujících PHA a zkoumání vlivu substrátu na produkci PHA.
Praktická část zkoumá vlivy různých druhů půd na produkci PHA a to se třemi vzrorovými mikroorganismy Cupriavidus necator, Escherichia coli a Pseudomonas mendocina, kdy se PHA detekuje fenotypovými metodami - barvení fluorescenscním barvivem Nile Blue a barvivem black Sudan s následným ověřením pomocí metody FTIR. Po vytipování půd pro nejlepší produkci PHA jsme dále produkci PHA zkoumali na celkem 77 mikroorganismech se stejným postupem pro jejich detekci, kdy bylo cílem zjistit, které kmeny PHA produkují a porovnat všechny 3 metody detekce.
Annotation in English
ABSTRACT
This master thesis is focused on the phenotypic identification and characterization of microbial polyhydroxyalkanoates (PHA) producers. The theoretical part of the master thesis deals with the characterization of polyhydroxyalkanoates with their possibility of obtaining from bacterial producers and their use. Furthermore, in the theoretical part we find the characterization of the microorganisms producing PHA and the study of the influence of the substrate on the production of PHA.
The practical part examines the effects of different soil types on PHA production with three growth microorganisms Cupriavidus necator, Escherichia coli and Pseudomonas mendocina, where PHA is detected by phenotypic methods - staining with fluorescent dye Nile Blue A and Sudan Black dye followed by verification using FTIR. After selecting the soils for the best PHA production, we further examined the production of PHA on microorganisms with the same procedure for their detection, the aim was to find out which strains of PHA produce and compare all 3 detection methods.
Keywords
Polyhydroxyalkanoáty, Biopolymery, Nile Blue A, Sudan Black, FTIR, detekce
Keywords in English
Polyhydroxyalkanoates, Biopolymers, Nile Blue A, Sudan Black, FTIR, detection
Length of the covering note
83
Language
CZ
Annotation
Předložená diplomová práce je zaměřená na fenotypovou identifikaci a charakterizaci producentů PHA. Teoretická část diplomové práce se zabývá charakterizací polyhydroxyalkanoatu s jejich mozností získávání z producentů a jejich využitím. Dále v teoretické části najdeme charakterizaci samotných mikroorganismů produkujících PHA a zkoumání vlivu substrátu na produkci PHA.
Praktická část zkoumá vlivy různých druhů půd na produkci PHA a to se třemi vzrorovými mikroorganismy Cupriavidus necator, Escherichia coli a Pseudomonas mendocina, kdy se PHA detekuje fenotypovými metodami - barvení fluorescenscním barvivem Nile Blue a barvivem black Sudan s následným ověřením pomocí metody FTIR. Po vytipování půd pro nejlepší produkci PHA jsme dále produkci PHA zkoumali na celkem 77 mikroorganismech se stejným postupem pro jejich detekci, kdy bylo cílem zjistit, které kmeny PHA produkují a porovnat všechny 3 metody detekce.
Annotation in English
ABSTRACT
This master thesis is focused on the phenotypic identification and characterization of microbial polyhydroxyalkanoates (PHA) producers. The theoretical part of the master thesis deals with the characterization of polyhydroxyalkanoates with their possibility of obtaining from bacterial producers and their use. Furthermore, in the theoretical part we find the characterization of the microorganisms producing PHA and the study of the influence of the substrate on the production of PHA.
The practical part examines the effects of different soil types on PHA production with three growth microorganisms Cupriavidus necator, Escherichia coli and Pseudomonas mendocina, where PHA is detected by phenotypic methods - staining with fluorescent dye Nile Blue A and Sudan Black dye followed by verification using FTIR. After selecting the soils for the best PHA production, we further examined the production of PHA on microorganisms with the same procedure for their detection, the aim was to find out which strains of PHA produce and compare all 3 detection methods.
Keywords
Polyhydroxyalkanoáty, Biopolymery, Nile Blue A, Sudan Black, FTIR, detekce
Keywords in English
Polyhydroxyalkanoates, Biopolymers, Nile Blue A, Sudan Black, FTIR, detection
Research Plan
I. Teoretická část
Charakteristika polyhydroxyalkanoátu (PHA)
Možnosti získávání a využití PHA
Charakteristika mikroorganizmů vyskytujících se při tvorbě PHA
Vliv substrátů na tvorbu PHA
II. Praktická část
Cíl práce
Metody pro kultivační stanovení produkce PHA
Screening producentů PHA
Vyhodnocení a zpracování výsledků
Diskuze a formulace závěrů
Research Plan
I. Teoretická část
Charakteristika polyhydroxyalkanoátu (PHA)
Možnosti získávání a využití PHA
Charakteristika mikroorganizmů vyskytujících se při tvorbě PHA
Vliv substrátů na tvorbu PHA
II. Praktická část
Cíl práce
Metody pro kultivační stanovení produkce PHA
Screening producentů PHA
Vyhodnocení a zpracování výsledků
Diskuze a formulace závěrů
Recommended resources
ANDERSON, A. J. a E. A. DAWES, 1990. Occurrence, metabolism, metabolic role, and industrial uses of bacterial polyhydroxyalkanoates. Microbiol Rev. 54(4), 450-472.
CHEN, Guo-Qiang a Junyu ZHANG. Microbial polyhydroxyalkanoates as medical implant biomaterials. Artificial Cells, Nanomedicine, and Biotechnology. 2017, 46(1), 1-18. DOI: 10.1080/21691401.2017.1371185. ISSN 2169-1401.
TUFAIL, Saiqa, Sajida MUNIR a Nazia JAMIL. Variation analysis of bacterial polyhydroxyalkanoates production using saturated and unsaturated hydrocarbons. Brazilian Journal of Microbiology. 2017, 48(4), 629-636. DOI: 10.1016/j.bjm.2017.02.008. ISSN 15178382.
MARTÍNEZ-GUTIÉRREZ, Carolina A., Hever LATISNERE-BARRAGÁN, José Q. GARCÍA-MALDONADO a Alejandro LÓPEZ-CORTÉS. Screening of polyhydroxyalkanoate-producing bacteria and PhaC-encoding genes in two hypersaline microbial mats from Guerrero Negro, Baja California Sur, Mexico. PeerJ. 2018, 6. DOI: 10.7717/peerj.4780. ISSN 2167-8359.
Databáze Web of Science
Doporučení dle vedoucího
Recommended resources
ANDERSON, A. J. a E. A. DAWES, 1990. Occurrence, metabolism, metabolic role, and industrial uses of bacterial polyhydroxyalkanoates. Microbiol Rev. 54(4), 450-472.
CHEN, Guo-Qiang a Junyu ZHANG. Microbial polyhydroxyalkanoates as medical implant biomaterials. Artificial Cells, Nanomedicine, and Biotechnology. 2017, 46(1), 1-18. DOI: 10.1080/21691401.2017.1371185. ISSN 2169-1401.
TUFAIL, Saiqa, Sajida MUNIR a Nazia JAMIL. Variation analysis of bacterial polyhydroxyalkanoates production using saturated and unsaturated hydrocarbons. Brazilian Journal of Microbiology. 2017, 48(4), 629-636. DOI: 10.1016/j.bjm.2017.02.008. ISSN 15178382.
MARTÍNEZ-GUTIÉRREZ, Carolina A., Hever LATISNERE-BARRAGÁN, José Q. GARCÍA-MALDONADO a Alejandro LÓPEZ-CORTÉS. Screening of polyhydroxyalkanoate-producing bacteria and PhaC-encoding genes in two hypersaline microbial mats from Guerrero Negro, Baja California Sur, Mexico. PeerJ. 2018, 6. DOI: 10.7717/peerj.4780. ISSN 2167-8359.
