Bakterie jsou sociální organismy, vytvářející na různých površích organizovaná společenství nazývající se biofilmy, které usnadňují přežití společenství větší odolností proti vnějším vlivům a zajištěním zdrojů živin. Quorum sensing je klíčovým mechanismem, kterým bakterie v biofilmu mezi sebou komunikují a který reguluje fenotypové vlastnosti jako je virulence, bioluminiscence, horizontální přenos DNA, syntéza antibiotik a bakteriocinů, a také tvorbu biofilmu.
V teoretické části je popsána charakteristika a vlastnosti rodu Lactobacillus, vlastnosti a tvorbu biofilm a je uveden také stručný přehled základních mechanismů quorum sensing včetně metod jejich detekce.
V části experimentální bylo cílem zjistit, které ze 45 vybraných druhů rodu Lactobacillus produkují biofilm a také vyhodnotit jejich růst pomocí růstových křivek. Tvorba biofilmu byla detekována pomocí Christensenovy metody.
Z výsledků vyplývá, že ze souboru 45 testovaných vzorků rodu Lactobacillus je 13 z nich schopno tvořit biofilm, což je předpokladem pro možnou aktivaci systému komunikace quorum sensing mezi těmito bakteriemi i v laboratorních podmínkách.
Anotace v angličtině
Bacteria are social organisms forming organized communities on various surfaces called biofilms, which allow the survival of the bacterial community by better resistance towards external factors and better nutrient acquisition. The quorum sensing is the key mechanism by which bacteria communicate and which regulates the phenotypic properties as virulence, bioluminescence, horizontal DNA transfer, synthesis of antibiotics and bacteriocins and also a biofilm formation.
The theoretical part describes the characteristics and properties of the genus Lactobacillus, formation and properties of a biofilm and also briefly overviews basic mechanisms of quorum sensing including detection methods.
The aim of the experimental part was to determine which of 45 selected strains of Lactobacillus produce the biofilm and to evaluate their growth according to growth curves. The biofilm formation was detected using the method of Christensen.
The results showed that from the set of 45 tested strains of Lactobacillus, 13 strains are able to weakly form the biofilm which is a presumption for a possible activation of quorum sensing communication among bacteria in laboratory conditions.
Klíčová slova
bakterie, biofilm, Christensenova metoda, Lactobacillus, quorum sensing, růstové křivky
Klíčová slova v angličtině
bacteria, biofilm, growth curves, Christensen method, Lactobacillus, quorum sensing
Rozsah průvodní práce
72
Jazyk
CZ
Anotace
Bakterie jsou sociální organismy, vytvářející na různých površích organizovaná společenství nazývající se biofilmy, které usnadňují přežití společenství větší odolností proti vnějším vlivům a zajištěním zdrojů živin. Quorum sensing je klíčovým mechanismem, kterým bakterie v biofilmu mezi sebou komunikují a který reguluje fenotypové vlastnosti jako je virulence, bioluminiscence, horizontální přenos DNA, syntéza antibiotik a bakteriocinů, a také tvorbu biofilmu.
V teoretické části je popsána charakteristika a vlastnosti rodu Lactobacillus, vlastnosti a tvorbu biofilm a je uveden také stručný přehled základních mechanismů quorum sensing včetně metod jejich detekce.
V části experimentální bylo cílem zjistit, které ze 45 vybraných druhů rodu Lactobacillus produkují biofilm a také vyhodnotit jejich růst pomocí růstových křivek. Tvorba biofilmu byla detekována pomocí Christensenovy metody.
Z výsledků vyplývá, že ze souboru 45 testovaných vzorků rodu Lactobacillus je 13 z nich schopno tvořit biofilm, což je předpokladem pro možnou aktivaci systému komunikace quorum sensing mezi těmito bakteriemi i v laboratorních podmínkách.
Anotace v angličtině
Bacteria are social organisms forming organized communities on various surfaces called biofilms, which allow the survival of the bacterial community by better resistance towards external factors and better nutrient acquisition. The quorum sensing is the key mechanism by which bacteria communicate and which regulates the phenotypic properties as virulence, bioluminescence, horizontal DNA transfer, synthesis of antibiotics and bacteriocins and also a biofilm formation.
The theoretical part describes the characteristics and properties of the genus Lactobacillus, formation and properties of a biofilm and also briefly overviews basic mechanisms of quorum sensing including detection methods.
The aim of the experimental part was to determine which of 45 selected strains of Lactobacillus produce the biofilm and to evaluate their growth according to growth curves. The biofilm formation was detected using the method of Christensen.
The results showed that from the set of 45 tested strains of Lactobacillus, 13 strains are able to weakly form the biofilm which is a presumption for a possible activation of quorum sensing communication among bacteria in laboratory conditions.
Klíčová slova
bakterie, biofilm, Christensenova metoda, Lactobacillus, quorum sensing, růstové křivky
Klíčová slova v angličtině
bacteria, biofilm, growth curves, Christensen method, Lactobacillus, quorum sensing
Zásady pro vypracování
I. Teoretická část
Charakteristika laktobacilů.
Biofilm.
II. Praktická část
Kultivační metody pro stanovení biofilm pozitivních bakterií.
Vliv laktobacilů na tvorbu biofilmů.
Vyhodnocení a zpracování výsledků.
Diskuze a formulace závěrů
Zásady pro vypracování
I. Teoretická část
Charakteristika laktobacilů.
Biofilm.
II. Praktická část
Kultivační metody pro stanovení biofilm pozitivních bakterií.
Vliv laktobacilů na tvorbu biofilmů.
Vyhodnocení a zpracování výsledků.
Diskuze a formulace závěrů
Seznam doporučené literatury
\par[1] {A.N. Ramos, M.E. Sesto Cabral, M.E. Arena, C.F. Arrighi, A.A. Arroyo Aguilar, J.C. Valdez, Compounds from Lactobacillus plantarum culture supernatants with potential pro-healing and anti-pathogenic properties in skin chronic wounds. Pharmaceutical Biology, 53 (3) (2015), pp. 350-358}
\par[2] {F.A. Sadiq, S. Flint, L. Yuan, Y. Li, T. Liu, G. He. Propensity for biofilm formation by aerobic mesophilic and thermophilic spore forming bacteria isolated from Chinese milk powders. International Journal of Food Microbiology, 262 (2017), pp. 89-98}
Seznam doporučené literatury
\par[1] {A.N. Ramos, M.E. Sesto Cabral, M.E. Arena, C.F. Arrighi, A.A. Arroyo Aguilar, J.C. Valdez, Compounds from Lactobacillus plantarum culture supernatants with potential pro-healing and anti-pathogenic properties in skin chronic wounds. Pharmaceutical Biology, 53 (3) (2015), pp. 350-358}
\par[2] {F.A. Sadiq, S. Flint, L. Yuan, Y. Li, T. Liu, G. He. Propensity for biofilm formation by aerobic mesophilic and thermophilic spore forming bacteria isolated from Chinese milk powders. International Journal of Food Microbiology, 262 (2017), pp. 89-98}
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Studentka představila komisi výsledky své diplomové práce. Poté byla komise seznámena s
posudky a hodnocením vedoucího a oponenta (hodnocení vedoucího: A – výborně,
hodnocení oponenta: A – výborně). V rámci posudků byly studentovi položeny následující dotazy oponenta: 1) Jaký vliv na tvorbu biofilmu má materiál podkladu? U Vámi pozitivně testovaných kmenů, dá se predikovat schopnost tvorby biofilmu i na jiném povrchu? 2) V práci se též zmiňujete o biosurfaktantech jako o látkách bránících tvorbě biofilmu. Jakou metodou by se dalo otestovat, zda bakterie takovéto látky produkují? Poté byla vedena diskuze o diplomové práci, během které byly jednotlivými členy komise položeny následující dotazy: prof. RNDr. Leona Buňková, Ph.D.: Co je to quorum sensing? prof. RNDr. Leona Buňková, Ph.D. Kolik bakterií z rodu Lactobacillus jste ve své práci popsala? prof. RNDr. Leona Buňková, Ph.D. Jaké podmínky pro tvorbu biofilmu jste ve své práci porovnávala? prof. RNDr. Leona Buňková, Ph.D.: Z jakého důvodu jste studovala růstové křivky Vámi testovanými bakteriemi? prof. RNDr. Leona Buňková, Ph.D. V kolika opakováních jste prováděla jednotlivá stanovení?
Studentka při obhajobě na většinu dotazů nedokázala uspokojivě odpovědět. V práci, kterou měla komise k dispozici, bylo nelezeno více formálních nedostatků a chybných a zavádějících informací. Navíc bylo shledáno, že náplň práce naprosto neodpovídala jejímu názvu, na což ve svém posudku neupozornil ani oponent. Z výše zmíněných důvodů se komise rozhodla udělit studentce hodnocení D-uspokojivě.