Biofilmy dokáží růst na polymerních materiálech a svou přítomností je mohou poškozo-vat a tím ohrožovat zdraví člověka. Na druhou stranu lze využít jejich rychlou metabolic-kou aktivitu na likvidaci odpadů ze životního prostředí. Cílem bakalářské práce bylo zjis-tit schopnost a množství tvorby biofilmu 6 bakteriálních kmenů na 4 biodegradabilních polymerech (PLA, PBAT, PBS a PBSA) a skle. Byla provedena identifikace bakteriálních kmenů pomocí fenotypu a následně sekvenací 16S rDNA a MALDI-TOF. Bakterie byly vyhodnoceny jako Bacillus spp., Bacillus subtilis, Bacillus pumilus, Acinetobacter lwoffii a dva odlišné kmeny Stenotrophomonas maltophilia. U všech těchto bakterií byla potvr-zena produkce biofilmu. Nejsilněji produkovaly biofilm druhy Stenotrophomonas mal-tophilia a Bacillus subtilis, tyto bakterie dokonce dokázaly růst na všech testovaných ma-teriálech alespoň při jedné z testovaných metod. Nejmenší produkce biofilmu byla shle-dána na PLA a skle, naopak k vysokému porůstání biofilmu docházelo u PBS a PBSA.
Annotation in English
Biofilms can grow on polymeric materials and by their presence they can damage poly-mers and endanger the health of individuals. On the other hand, we can use their rapid metabolic activity and biofilms dispose of waste from the environment. The aim of this thesis was to determine the ability and amount of biofilm formation of 6 bacterial strains on 4 biodegradable polymers (PLA, PBAT, PBS and PBSA) and glass. Bacterial strains were identified by sequencing 16S rDNA and MALDI-TOF. The bacteria were identified as Bacillus spp., Bacillus subtilis, Bacillus pumilus, Acinetobacter lwoffii and two strains of Stenotrophomonas maltophilia. Biofilm production was confirmed in all of these bac-teria. Stenotrophomonas maltophilia and Bacillus subtilis have produced the strongest biofilm, and these bacteria have even proven to grow on all the tested materials in at least one of the methods tested. The smallest biofilm production was found on PLA and glass, while the high biofilm growth was on PBS and PBSA.
Biofilmy dokáží růst na polymerních materiálech a svou přítomností je mohou poškozo-vat a tím ohrožovat zdraví člověka. Na druhou stranu lze využít jejich rychlou metabolic-kou aktivitu na likvidaci odpadů ze životního prostředí. Cílem bakalářské práce bylo zjis-tit schopnost a množství tvorby biofilmu 6 bakteriálních kmenů na 4 biodegradabilních polymerech (PLA, PBAT, PBS a PBSA) a skle. Byla provedena identifikace bakteriálních kmenů pomocí fenotypu a následně sekvenací 16S rDNA a MALDI-TOF. Bakterie byly vyhodnoceny jako Bacillus spp., Bacillus subtilis, Bacillus pumilus, Acinetobacter lwoffii a dva odlišné kmeny Stenotrophomonas maltophilia. U všech těchto bakterií byla potvr-zena produkce biofilmu. Nejsilněji produkovaly biofilm druhy Stenotrophomonas mal-tophilia a Bacillus subtilis, tyto bakterie dokonce dokázaly růst na všech testovaných ma-teriálech alespoň při jedné z testovaných metod. Nejmenší produkce biofilmu byla shle-dána na PLA a skle, naopak k vysokému porůstání biofilmu docházelo u PBS a PBSA.
Annotation in English
Biofilms can grow on polymeric materials and by their presence they can damage poly-mers and endanger the health of individuals. On the other hand, we can use their rapid metabolic activity and biofilms dispose of waste from the environment. The aim of this thesis was to determine the ability and amount of biofilm formation of 6 bacterial strains on 4 biodegradable polymers (PLA, PBAT, PBS and PBSA) and glass. Bacterial strains were identified by sequencing 16S rDNA and MALDI-TOF. The bacteria were identified as Bacillus spp., Bacillus subtilis, Bacillus pumilus, Acinetobacter lwoffii and two strains of Stenotrophomonas maltophilia. Biofilm production was confirmed in all of these bac-teria. Stenotrophomonas maltophilia and Bacillus subtilis have produced the strongest biofilm, and these bacteria have even proven to grow on all the tested materials in at least one of the methods tested. The smallest biofilm production was found on PLA and glass, while the high biofilm growth was on PBS and PBSA.
Charakteristika mikroorganizmů vyskytujících se při tvorbě biofilmů.
Charakteristika a výskyt biofilmů
Možnosti detekce biofilmů
II. Praktická část
Kultivační metody pro stanovení biofilm pozitivních bakterií
Vliv kultivačních podmínek na tvorbu biofilmů.
Vyhodnocení a zpracování výsledků
Diskuze a formulace závěrů
Research Plan
Teoretická část
Charakteristika mikroorganizmů vyskytujících se při tvorbě biofilmů.
Charakteristika a výskyt biofilmů
Možnosti detekce biofilmů
II. Praktická část
Kultivační metody pro stanovení biofilm pozitivních bakterií
Vliv kultivačních podmínek na tvorbu biofilmů.
Vyhodnocení a zpracování výsledků
Diskuze a formulace závěrů
Recommended resources
HSIEH, Ke Ming, George A. MURGEL, Leonard W. LION a Michael L. SHULER. Interactions of microbial biofilms with toxic trace metals: 1. Observation and modeling of cell growth, attachment, and production of extracellular polymer. Biotechnology and Bioengineering. 1994, 44(2), 219-231 [cit. 2018-06-15]. DOI: 10.1002/bit.260440211. ISSN 0006-3592.
PANDIT, Santosh, Vaishnavi RAVIKUMAR, Alyaa M. ABDEL-HALEEM, et al. Low Concentrations of Vitamin C Reduce the Synthesis of Extracellular Polymers and Destabilize Bacterial Biofilms. Frontiers in Microbiology. 2017, 8, - [cit. 2018-06-15]. DOI: 10.3389/fmicb.2017.02599. ISSN 1664-302X.
Dle doporučení vedoucího.
Databáze Web of Science
Recommended resources
HSIEH, Ke Ming, George A. MURGEL, Leonard W. LION a Michael L. SHULER. Interactions of microbial biofilms with toxic trace metals: 1. Observation and modeling of cell growth, attachment, and production of extracellular polymer. Biotechnology and Bioengineering. 1994, 44(2), 219-231 [cit. 2018-06-15]. DOI: 10.1002/bit.260440211. ISSN 0006-3592.
PANDIT, Santosh, Vaishnavi RAVIKUMAR, Alyaa M. ABDEL-HALEEM, et al. Low Concentrations of Vitamin C Reduce the Synthesis of Extracellular Polymers and Destabilize Bacterial Biofilms. Frontiers in Microbiology. 2017, 8, - [cit. 2018-06-15]. DOI: 10.3389/fmicb.2017.02599. ISSN 1664-302X.
