Diplomová práce popisuje proces kultivace, izolace a identifikace mikroorganismů, které byly schopny degradovat PBAT ve vzorcích půd z okolí Zlína. Kultivace degradérů probíhala při 58 °C po dobu 7 dní. Na kultivačních půdách se submikročásticemi PBAT rostly i jiné mikroorganismy, avšak snahou bylo vybrat k izolaci mikroorganismy, kolem jejichž kolonií byly prosvětlené zóny svědčící o degradaci polymeru. Izolace DNA byla provedena metodou chloroform/izoamylalkoholu (24:1). Pomocí metody DGGE byla provedena identifikace směsných mikrobiálních konsorcií degradujících polyester. V rámci práce byla jako častý degradující organismus identifikována termofilní aktinomyceta Thermobispora bispora. Dále byly identifikovány mikroorganismy, které se v degradujících konsorciích rovněž vyskytovaly např.Paenibacillus sp., Thermobacillus sp, Bacillus alveayuensis, Aeribacillus sp, Geobacillus sp. Práce ukazuje, že v přirozeném půdním prostředí je možné nalézt degradéry PBAT a jsou poměrně četní.
Anotace v angličtině
The thesis describes the process of cultivation, isolation and identification of mi-croorganisms that are able to degrade PBAT in soil samples from around Zlín. Cultivation of degraders was carried out at 58 ° C for 7 days. Also other microorganisms grew on culture media with PBAT micro-particles, but the aim was to choose and isolate microorgan-isms were bright zones around their colonies indicated the polymer degradation. Isolation of DNA was performed by chloroform/isoamyl alcohol (24: 1) method. DGGE method was used for the identification of mixed microbial consortia that degrade the polyester. In this work as a frequent degrading organism thermophilic actinomycete Thermobispora bispora was identified. Further, microorganisms have been identified in the degradation consortia e.g. Paenibacillus sp., Thermobacillus sp, Bacillus alveayuensis, Aeribacillus sp. Geobacillus sp. This work shows that in natural soil environment PBAT degraders can be found and are quite ubiquitous.
Diplomová práce popisuje proces kultivace, izolace a identifikace mikroorganismů, které byly schopny degradovat PBAT ve vzorcích půd z okolí Zlína. Kultivace degradérů probíhala při 58 °C po dobu 7 dní. Na kultivačních půdách se submikročásticemi PBAT rostly i jiné mikroorganismy, avšak snahou bylo vybrat k izolaci mikroorganismy, kolem jejichž kolonií byly prosvětlené zóny svědčící o degradaci polymeru. Izolace DNA byla provedena metodou chloroform/izoamylalkoholu (24:1). Pomocí metody DGGE byla provedena identifikace směsných mikrobiálních konsorcií degradujících polyester. V rámci práce byla jako častý degradující organismus identifikována termofilní aktinomyceta Thermobispora bispora. Dále byly identifikovány mikroorganismy, které se v degradujících konsorciích rovněž vyskytovaly např.Paenibacillus sp., Thermobacillus sp, Bacillus alveayuensis, Aeribacillus sp, Geobacillus sp. Práce ukazuje, že v přirozeném půdním prostředí je možné nalézt degradéry PBAT a jsou poměrně četní.
Anotace v angličtině
The thesis describes the process of cultivation, isolation and identification of mi-croorganisms that are able to degrade PBAT in soil samples from around Zlín. Cultivation of degraders was carried out at 58 ° C for 7 days. Also other microorganisms grew on culture media with PBAT micro-particles, but the aim was to choose and isolate microorgan-isms were bright zones around their colonies indicated the polymer degradation. Isolation of DNA was performed by chloroform/isoamyl alcohol (24: 1) method. DGGE method was used for the identification of mixed microbial consortia that degrade the polyester. In this work as a frequent degrading organism thermophilic actinomycete Thermobispora bispora was identified. Further, microorganisms have been identified in the degradation consortia e.g. Paenibacillus sp., Thermobacillus sp, Bacillus alveayuensis, Aeribacillus sp. Geobacillus sp. This work shows that in natural soil environment PBAT degraders can be found and are quite ubiquitous.
1. Proveďte literární rešerši na dané téma.
2. Vypracujte metodiku identifikace a charakterizace degradérů PBAT.
3. Přizpůsobte metodiku charakteru zkoumaných vzorků.
4. Interpretujte získaná data.
5. Výsledky přehledně zpracujte do formy DP.
Zásady pro vypracování
1. Proveďte literární rešerši na dané téma.
2. Vypracujte metodiku identifikace a charakterizace degradérů PBAT.
3. Přizpůsobte metodiku charakteru zkoumaných vzorků.
4. Interpretujte získaná data.
5. Výsledky přehledně zpracujte do formy DP.
Seznam doporučené literatury
Články v odborných periodicích dostupných v databázích Web of Science, Scopus, případně dalších.
Seznam doporučené literatury
Články v odborných periodicích dostupných v databázích Web of Science, Scopus, případně dalších.
Přílohy volně vložené
1x CD
Přílohy vázané v práci
tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Diplomantka odpověděla na dotazy uvedené v recenzním posudku a odpověděla na dotazy, které jí položili členové komise.