Biogenní aminy jsou nízkomolekulární dusíkaté látky s významnými biologickými účinky. Vznikají převážně dekarboxylací aminokyselin. Kvůli svým toxickým účinům jsou sledovány především v potravinách. Předkládaná práce je zaměřena na studium dekarboxylasové aktivity u bakterií vyskytujících se v biotických prostředích. Bylo izolováno celkem 61 bakteriálních kmenů z půdy a stojaté povrchové vody. Identifikace jednotlivých kmenů byla provedena technikou MALDI/TOF. Podařilo se identifikovat 36 izolovaných bakterií, z nich 44 % patřilo do rodu Bacillus. Screening dekarboxylasové aktivity bakterií byl realizován kultivační metodou. Významnou dekarboxylační aktivitu izolovaných bakterií potvrdilo i následné stanovení produkce jednotlivých biogenních aminů metodou HPLC UV/Vis. Nejčastěji byl detekován spermin (v desítkách mg/l) a spermidin (v jednotkách mg/l). Obzvlášť vysoká byla schopnost bakterií tvořit tyramin (ve stovkách mg/l). Žádný ze sledovaných kmenů neprodukoval histamin a tryptamin.
Annotation in English
Biogenic amines (BAs) are low molecular weight nitrogen compounds with significant biological effects. They are usually produced by decarboxylation of aminoacids. Because of their toxic effects, BAs are monitored especially in food. Presented thesis concentrates on screening of decarboxylase activity of environmental bacteria. 61 bacterial strains were isolated from soil and standing surface freshwater. The identification of the particular strains was made by the MALDI/TOF technique. We managed to identify 36 isolated bacteria, 44 % of them belonged to the genus Bacillus. Screening of decarboxylase activity of the bacteria was realised by the cultivation method. Significant decarboxylation activity was confirmed by HPLC UV/Vis analysis. Spermine (tens of mg/l) and spermidine (units of mg/l) were the most frequently detected BAs. The ability of bacteria to produce tyramine was especially high (hundreds of mg/l). None of the isolated bacteria produced histamine and tryptamine.
Biogenní aminy jsou nízkomolekulární dusíkaté látky s významnými biologickými účinky. Vznikají převážně dekarboxylací aminokyselin. Kvůli svým toxickým účinům jsou sledovány především v potravinách. Předkládaná práce je zaměřena na studium dekarboxylasové aktivity u bakterií vyskytujících se v biotických prostředích. Bylo izolováno celkem 61 bakteriálních kmenů z půdy a stojaté povrchové vody. Identifikace jednotlivých kmenů byla provedena technikou MALDI/TOF. Podařilo se identifikovat 36 izolovaných bakterií, z nich 44 % patřilo do rodu Bacillus. Screening dekarboxylasové aktivity bakterií byl realizován kultivační metodou. Významnou dekarboxylační aktivitu izolovaných bakterií potvrdilo i následné stanovení produkce jednotlivých biogenních aminů metodou HPLC UV/Vis. Nejčastěji byl detekován spermin (v desítkách mg/l) a spermidin (v jednotkách mg/l). Obzvlášť vysoká byla schopnost bakterií tvořit tyramin (ve stovkách mg/l). Žádný ze sledovaných kmenů neprodukoval histamin a tryptamin.
Annotation in English
Biogenic amines (BAs) are low molecular weight nitrogen compounds with significant biological effects. They are usually produced by decarboxylation of aminoacids. Because of their toxic effects, BAs are monitored especially in food. Presented thesis concentrates on screening of decarboxylase activity of environmental bacteria. 61 bacterial strains were isolated from soil and standing surface freshwater. The identification of the particular strains was made by the MALDI/TOF technique. We managed to identify 36 isolated bacteria, 44 % of them belonged to the genus Bacillus. Screening of decarboxylase activity of the bacteria was realised by the cultivation method. Significant decarboxylation activity was confirmed by HPLC UV/Vis analysis. Spermine (tens of mg/l) and spermidine (units of mg/l) were the most frequently detected BAs. The ability of bacteria to produce tyramine was especially high (hundreds of mg/l). None of the isolated bacteria produced histamine and tryptamine.
1. Vypracovat literární rešerši, která se bezprostředně týká zadaného tématu. 2. Izolovat vhodné biodegradéry v různých biotických prostředích. 3. Provést screening dekarboxylasové aktivity (na kultivačním médiu, s jednotlivými aminokyselinami). 4. Teorii a zjištěné poznatky sepsat do formy bakalářské práce.
Research Plan
1. Vypracovat literární rešerši, která se bezprostředně týká zadaného tématu. 2. Izolovat vhodné biodegradéry v různých biotických prostředích. 3. Provést screening dekarboxylasové aktivity (na kultivačním médiu, s jednotlivými aminokyselinami). 4. Teorii a zjištěné poznatky sepsat do formy bakalářské práce.
Recommended resources
Vědecké databáze (Web of Science, Science Direct, PubMed), vědecká a odborná literatura.
Recommended resources
Vědecké databáze (Web of Science, Science Direct, PubMed), vědecká a odborná literatura.
